MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 2604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012806	AT	3	6	25	30	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012806	TTAA	2	8	31	38	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012806	ATT	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012806	ATT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012806	ATA	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012806	A	6	6	81	86	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012806	A	7	7	1523	1529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012806	TTA	3	9	1592	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012806	TAAA	2	8	1607	1614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012806	TAAG	2	8	1615	1622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012806	TAAA	2	8	1623	1630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012806	A	6	6	7202	7207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012806	A	9	9	7209	7217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012806	T	10	10	7234	7243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012806	T	6	6	7245	7250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012806	TCATA	2	10	10926	10935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012806	T	6	6	10950	10955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012806	A	6	6	10994	10999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012806	T	7	7	11004	11010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012806	A	6	6	11011	11016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012806	AAT	2	6	11029	11034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012806	TAA	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012806	A	6	6	11041	11046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012806	TAAA	2	8	11065	11072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012806	TAT	2	6	11076	11081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012806	A	6	6	11107	11112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012806	T	6	6	11117	11122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012806	CTT	2	6	11147	11152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012806	T	8	8	11167	11174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012806	GAAAAT	2	12	11194	11205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012806	ATAA	2	8	11479	11486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012806	AAT	2	6	11492	11497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012806	T	6	6	11507	11512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012806	A	6	6	11513	11518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012806	TAT	2	6	11519	11524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012806	ATT	2	6	11526	11531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012806	GAA	2	6	11539	11544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012806	T	7	7	11553	11559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012806	T	6	6	11587	11592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012806	T	6	6	11599	11604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012806	T	6	6	11606	11611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012806	A	7	7	11641	11647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012806	AAT	2	6	16027	16032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012806	ATA	2	6	18221	18226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012806	A	7	7	21980	21986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012806	ACA	2	6	22019	22024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012806	T	6	6	22038	22043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012806	TAT	2	6	22087	22092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012806	CTTTC	2	10	22093	22102	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_012806	A	7	7	23061	23067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012806	T	8	8	23084	23091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012806	AG	3	6	23106	23111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012806	TTTA	2	8	23171	23178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012806	TAA	2	6	23201	23206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012806	ATTA	2	8	23207	23214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012806	TCTT	2	8	23231	23238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012806	T	6	6	23237	23242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012806	T	7	7	23261	23267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012806	A	14	14	23276	23289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012806	TAATT	2	10	23316	23325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012806	T	6	6	23340	23345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012806	A	6	6	23371	23376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012806	AGG	2	6	24575	24580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012806	A	6	6	26864	26869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012806	ACA	2	6	26891	26896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012806	A	6	6	26896	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012806	TTTA	2	8	26906	26913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012806	T	8	8	26920	26927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012806	T	7	7	26941	26947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012806	A	7	7	26957	26963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012806	TAA	2	6	26980	26985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012806	ATT	2	6	29052	29057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012806	T	8	8	29056	29063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012806	TCT	2	6	29081	29086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012806	TA	3	6	29090	29095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012806	AT	3	6	29105	29110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012806	TAA	2	6	29118	29123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012806	T	6	6	31189	31194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012806	TTTTTA	2	12	31211	31222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012806	TTG	2	6	31227	31232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012806	TA	3	6	31240	31245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012806	ATT	2	6	31266	31271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012806	TAAA	2	8	31302	31309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012806	A	6	6	31307	31312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012806	A	7	7	31314	31320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012806	T	6	6	32164	32169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012806	ATA	3	9	32195	32203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012806	TAT	2	6	32216	32221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012806	CCA	2	6	32299	32304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012806	A	7	7	32321	32327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012806	ATTTT	3	15	35106	35120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012806	TGT	2	6	35127	35132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012806	TAAC	2	8	36014	36021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012806	TAT	2	6	36041	36046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012806	TTAT	2	8	36066	36073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012806	A	6	6	36087	36092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012806	ATT	2	6	36100	36105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012806	ATA	3	9	41986	41994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012806	T	7	7	42524	42530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012806	AAAAG	2	10	42533	42542	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012806	A	6	6	42546	42551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012806	ATA	2	6	43209	43214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012806	ATT	2	6	43229	43234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012806	A	8	8	43239	43246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012806	A	6	6	43256	43261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012806	A	7	7	44722	44728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012806	T	6	6	44747	44752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012806	A	6	6	44762	44767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012806	AC	3	6	44879	44884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012806	GT	3	6	44897	44902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012806	A	18	18	46858	46875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012806	AAT	2	6	46902	46907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012806	ATTT	2	8	46926	46933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012806	TTTCTT	2	12	46937	46948	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012806	ATA	2	6	46973	46978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012806	A	7	7	46998	47004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012806	ATT	2	6	47013	47018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012806	TAT	2	6	47058	47063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012806	TCA	2	6	49308	49313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012806	TCAA	2	8	49346	49353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012806	ATC	2	6	49355	49360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012806	A	7	7	49367	49373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012806	TCC	2	6	50779	50784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_012806	T	6	6	51156	51161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012806	T	6	6	51166	51171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012806	ATA	2	6	51197	51202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012806	TA	3	6	51206	51211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012806	A	6	6	52465	52470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012806	A	7	7	52473	52479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012806	ATA	2	6	52492	52497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012806	AT	3	6	54204	54209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012806	A	8	8	54226	54233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012806	A	7	7	54241	54247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012806	A	8	8	54629	54636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012806	ATT	2	6	54685	54690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012806	AT	3	6	54692	54697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012806	T	6	6	54702	54707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012806	A	6	6	54723	54728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012806	ATT	2	6	54745	54750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012806	AATA	2	8	54763	54770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012806	ATTA	2	8	54790	54797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012806	A	6	6	54805	54810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012806	T	6	6	54815	54820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012806	TTA	2	6	54822	54827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012806	TTA	2	6	54849	54854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012806	T	6	6	54881	54886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012806	TAAA	2	8	59501	59508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012806	CAA	2	6	59510	59515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_012806	A	7	7	59514	59520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012806	ATA	2	6	59528	59533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012806	A	7	7	59543	59549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012806	GTT	2	6	59563	59568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012806	T	8	8	59567	59574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012806	AGG	3	9	59585	59593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_012806	AAT	2	6	127986	127991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012806	TA	4	8	128029	128036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_012806	AAT	2	6	128048	128053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012806	TA	3	6	128058	128063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_012806	TTA	2	6	128092	128097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_012806	TAAT	2	8	144030	144037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012806	TAA	2	6	145812	145817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012806	TTA	2	6	152408	152413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_012806	AAT	2	6	152415	152420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012806	TA	3	6	153733	153738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_012806	TAT	2	6	159957	159962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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